経歴
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2019年05月-継続中
お茶の水女子大学 研究・産学連携本部 研究推進部 【教育研究部門】 文理融合AI・データサイエンスセンター 副センター長
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2017年04月-継続中
早稲田大学 先進理工学部 教授
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2016年04月-2019年03月
お茶の水女子大学 学長 学長補佐
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早稲田大学 理工学術院
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お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科 教授
2023/11/28 更新
お茶の水女子大学 研究・産学連携本部 研究推進部 【教育研究部門】 文理融合AI・データサイエンスセンター 副センター長
早稲田大学 先進理工学部 教授
お茶の水女子大学 学長 学長補佐
早稲田大学 理工学術院
お茶の水女子大学 大学院人間文化創成科学研究科 教授
名古屋大学 理学研究科 生物学
名古屋大学
早稲田大学 理工学部 応用物理学
早稲田大学
日本生物物理学会 2020年会実行委員会副委員長
日本生物物理学会 副会長
日本生物物理学会 運営委員
米国生物物理学会
日本蛋白質科学会
日本分子生物学会
日本生物物理学会
生物物理学
計算生物学
Isolation and genomic analysis of a type IV pili-independent Thermus thermophilus phage, φMN1 from a Japanese hot spring.
Masatada Tamakoshi, Atsushi Hijikata, Kei Yura, Kenshiro Oshima, Hidehiro Toh, Kaoru Mitsuoka, Tairo Oshima, Yoshitaka Bessho
The Journal of general and applied microbiology 2023年07月 [査読有り] [国内誌]
Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ryota Wagatsuma, Katsuhiko Mineta, Kai Takahashi, Keigo Ide, Kei Yura, Hayedeh Behzad, Takashi Gojobori, Haruko Takeyama
ISME Communications 2 ( 1 ) 2022年09月 [査読有り]
Noe Kaneko, Kumiko Hirai, Minori Oshima, Kei Yura, Mitsuharu Hattori, Nobuaki Maeda, Chiaki Ohtaka-Maruyama
2022年08月 [査読有り]
佐々木 元子, 川目 裕, 松尾 真理, 小杉 眞司, 櫻井 晃洋, 由良 敬, 高島 響子, 李 怡然, 松川 愛未, 大住 理沙, 神原 容子, 三宅 秀彦
日本遺伝カウンセリング学会誌 43 ( 2 ) 144 - 144 2022年06月
Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano, Koji Kinjo, Michihiro Ito, Masahito Hosokawa, Kei Yura, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama
bioRxiv 2022年04月
Co-expression network analysis of environmental canalization in the ascidian Ciona
Atsuko Sato, Gina M Oba, Nathanael Aubert-Kato, Kei Yura, John Bishop
BMC Ecology and Evolution 22 53 - 53 2022年04月 [査読有り]
Single-cell metabolite detection and genomics reveals uncultivated talented producer
Masato Kogawa, Rimi Miyaoka, Franziska Hemmerling, Masahiro Ando, Kei Yura, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Yuji Ise, Jackson K B Cahn, Kentaro Takada, Shigeki Matsunaga, Tetsushi Mori, Jörn Piel, Haruko Takeyama
PNAS Nexus 1 ( 1 ) 2022年03月 [査読有り]
Xiaojuan Zhang, Mika Nomoto, Marta Garcia-León, Naoki Takahashi, Mariko Kato, Kei Yura, Masaaki Umeda, Vicente Rubio, Yasuomi Tada, Tsuyoshi Furumoto, Takashi Aoyama, Tomohiko Tsuge
Plant and Cell Physiology 63 ( 3 ) 369 - 383 2022年01月 [査読有り]
Dissecting Cricket Genomes for Advancement of Entomology and Entomophagy
Kosuke Kataoka, Yuki Togawa, Ryuto Sanno, Toru Asahi, Kei Yura
Biophysical Reviews 14 75 - 97 2022年01月 [査読有り]
Puromycin-based purification of cells with high expression of the cytochrome P450 CYP3A4 gene from a patient with drug-induced liver infury (DILI)
Shoko Miyata, Noriaki Saku, Saeko Akiyama, Palaksha Kanive, Javaregowda, Kenta Ite, Nagisa Takashima, Masashi Toyoda, Kei Yura, Tohru Kimura, Hiroshi Nishina, Atsuko Nakazawa, Mureo Kasahara, Hidenori Nonaka, Tohru Kiyono, Akihiro Umezawa
Stem Cell Research & Therapy 13 ( 1 ) 6 - 6 2022年01月 [査読有り] [国際誌]
Protein Data Bank Japan: Celebrating our 20th anniversary during a global pandemic as the Asian hub of three dimensional macromolecular structural data.
Gert-Jan Bekker, Masashi Yokochi, Hirofumi Suzuki, Yasuyo Ikegawa, Takeshi Iwata, Takahiro Kudou, Kei Yura, Toshimichi Fujiwara, Takeshi Kawabata, Genji Kurisu
Protein science : a publication of the Protein Society 31 ( 1 ) 173 - 186 2022年01月 [査読有り] [国際誌]
Multi-omics analysis reveals cross-organism interactions in coral holobiont
Toru Maruyama, Michihiro Ito, Satoshi Wakaoji, Yusuke Okubo, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Hiroyuki Fujimura, Shoichiro Suda, Yoshikatsu Nakano, Noriyuki Satoh, Chuya Shinzato, Kei Yura, Haruko Takeyama
bioRxiv 2021年10月
Comparative Analysis of Mitochondrial Genomes in Gryllidea (Insecta: Orthoptera): Implications for Adaptive Evolution in Ant-loving Crickets.
Ryuto Sanno, Kosuke Kataoka, Shota Hayakawa, Keigo Ide, Chuong N Nguyen, Thao P Nguyen, Binh T N Le, Oanh T P Kim, Katsuhiko Mineta, Haruko Takeyama, Makio Takeda, Toshiyuki Sato, Takeshi Suzuki, Kei Yura, Toru Asahi
Genome biology and evolution 13 ( 10 ) 2021年09月 [国際誌]
佐々木 元子, 川目 裕, 小杉 眞司, 櫻井 晃洋, 松尾 真理, 由良 敬, 高島 響子, 李 怡然, 松川 愛未, 神原 容子, 三宅 秀彦
日本遺伝カウンセリング学会誌 42 ( 2 ) 118 - 118 2021年06月
Edible wild field cricket (Brachytrupes portentosus) trading in Bangladesh.
Md. Mehedi Hasan, Md. Mostafizur Rahman, Kosuke Kataoka, Kei Yura, Md. Omar Faruque, Faysal Rabby Shadhen, Md Fuad Mondal
Journal of Insects as Food and Feed 7 ( 8 ) 1255 - 1126 2021年06月 [査読有り]
由良 敬, 鈴木丈詞, 渡邉崇人, 小倉 淳, 朝日 透, 生田和正, 霜田政美, 森岡伸介, 佐藤秀一, 中村龍平
JATAFFジャーナル 9 ( 6 ) 14 - 19 2021年06月
Regulatory properties of vitronectin and its glycosylation in collagen fibril formation and collagen degrading enzyme cathepsin K activity
Kimie Date, Hiromi Sakagami, Kei Yura
Scientific Reports 11 12023 2021年06月 [査読有り]
Multiple Mutations in RNA Polymerase β-Subunit Gene (rpoB) in Streptomyces incarnatus NRRL8089 Enhance Production of Antiviral Antibiotic Sinefungin: Modeling rif Cluster Region by Density Functional Theory
Saori Ogawa, Hitomi Shimidzu, Koji Fukuda, Naoki Tsunekawa, Toshiyuki Hirano, Fumitoshi Sato, Kei Yura, Tomohisa Hasunuma, Kozo Ochi, Michio Yamamoto, Wataru, Sakamoto, Kentaro Hashimoto, Hiroyuki Ogata, Tadayoshi Kanao, Michiko Nemoto, Kenji Inagaki, Takashi Tamura
Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 85 ( 5 ) 1275 - 1282 2021年05月 [査読有り] [国際誌]
Complete Genome Sequences of Thermus thermophilus Strains HB5002 and HB5008, Isolated from Mine Hot Spring in Japan
Kentaro Miyazaki, Toshiyuki Moriya, Natsuko Tokito, Tairo Oshima, Kei Yura, Yoshitaka Bessho
Microbiology Resource Announcements 10 e00272-21 2021年04月 [査読有り]
Exploration of natural red-shifted rhodopsins using a machine learning-based Bayesian experimental design
Keiichi Inoue, Masayuki Karasuyama, Ryoko Nakamura, Masae Konno, Daichi Yamada, Kentaro Mannen, Takashi Nagata, Yu Inatsu, Kei Yura, Oded Béjà, Hideki Kandori, Ichiro Takeuchi
Communications Biology 4 362 2021年03月 [査読有り]
Complete Genome Sequence of Thermus thermophilus Strain HB5018, Isolated from Mine Hot Spring in Japan
Kentaro Miyazaki, Toshiyuki Moriya, Naoki Nemoto, Tairo Oshima, Kei Yura, Yoshitaka Bessho
Microbiology Resource Announcements 10 e0039-21 2021年03月 [査読有り]
A novel circular ssDNA virus of the phylum Cressdnaviricota discovered in metagenomic data from otter clams (Lutraria rhynchaena)
Oanh T. P. Kim, Yuki Kagaya, Hoang S. Tran, Ryuhei Minei, Trang T. H. Tran, Ha T. T. Duong, Binh T. N. Le, Lua T. Dang, Kengo Kinoshita, Atsushi Ogura, Kei Yura
Archives of Virology 165 ( 12 ) 2921 - 2926 2020年12月 [査読有り] [国際誌]
Genomic and Transcriptomic Analyses of Bioluminescence Genes in the Enope Squid Watasenia scintillans
Masa-aki Yoshida, Junichi Imoto, Yuri Kawai, Satomi Funahashi, Ryuhei Minei, Yuki Akizuki, Atsushi Ogura, Kazuhiko Nakabayashi, Kei Yura, Kazuho Ikeo
Marine Biotechnology 22 ( 6 ) 760 - 771 2020年12月 [査読有り] [招待有り] [国際誌]
Past, Present and Future of Ewha-JWU-Ochanomizu Joint Symposium
Kei Yura
Natural Science Report, Ochanomizu University 2020年09月 [査読有り] [招待有り] [国内誌]
Saki Aoto, Mayu Fushimi, Kei Yura, Kohji Okamura
Mammalian Genome 2020年07月 [査読有り]
Kei Yura
Frontiers in Genetics 11 2020年05月 [査読有り]
Kei Yura
British Journal of Cancer Research 2020年04月 [国際誌]
Biophysics at Waseda University
Mitsunori Takano, Kei Yura, Taro Uyeda, Kenji Yasuda
Biophysical Reviews 12 ( 2 ) 225 - 232 2020年04月 [査読有り]
Metagenome Sequences from the Environment of Diseased Otter Clams, Lutraria rhynchaena, from a Farm in Vietnam
Yuki Kagaya, Ryuhei Minei, Ha T. T. Duong, Binh T. N. Le, Lua T. Dang, Trang T. H. Tran, Hoa T. Nguyen, Kengo Kinoshita, Kei Yura, Atsushi Ogura, Oanh T. P. Kim, Kenneth M. Stedman
Microbiology Resource Announcements 9 ( 2 ) 2020年01月 [査読有り]
A prospective compound screening contest identified broader inhibitors for Sirtuin 1
Kei Yura
Scientific Reports 9 ( 1 ) 2019年12月 [査読有り]
Kei Yura
Biophysics and Physicobiology 16 ( 0 ) 68 - 79 2019年 [査読有り]
Starfish Apaf-1 activates effector caspase-3/9 upon apoptosis of aged eggs
Tamura, R., Takada, M., Sakaue, M., Yoshida, A., Ohi, S., Hirano, K., Hayakawa, T., Hirohashi, N., Yura, K., Chiba, K.
Scientific Reports 8 ( 1 ) 1611 - 1611 2018年 [査読有り] [国際誌]
Synaptic transmission from subplate neurons controls radial migration of neocortical neurons
Ohtaka-Maruyama, C., Okamoto, M., Endo, K., Oshima, M., Kaneko, N., Yura, K., Okado, H., Miyata, T., Maeda, N.
Science 360 ( 6386 ) 313 - 317 2018年 [査読有り]
iMusta4SLC: Database for the structural property and variations of solute carrier transporters
Akiko Higuchi, Naoki Nonaka, Kei Yura
Biophysics and Physicobiology 15 ( 0 ) 94 - 103 2018年 [査読有り]
REFOLDdb: A new and sustainable gateway to experimental protocols for protein refolding
Mizutani, H., Sugawara, H., Buckle, A.M., Sangawa, T., Miyazono, K.-I., Ohtsuka, J., Nagata, K., Shojima, T., Nosaki, S., Xu, Y., Wang, D., Hu, X., Tanokura, M., Yura, K.
BMC Structural Biology 17 ( 1 ) 4 2017年 [査読有り]
Hayashi, K., Kawai, Y.L., Yura, K., Yoshida, M.-A., Ogura, A., Hata, K., Nakabayashi, K., Okamura, K.
Mitochondrial DNA. Part A, DNA mapping, sequencing, and analysis 27 ( 3 ) 1842 - 1843 2016年 [査読有り]
VaProS: a database-integration approach for protein/genome information retrieval
Gojobori, T., Ikeo, K., Katayama, Y., Kawabata, T., Kinjo, A.R., Kinoshita, K., Kwon, Y., Migita, O., Mizutani, H., Muraoka, M., Nagata, K., Omori, S., Sugawara, H., Yamada, D., Yura, K.
Journal of Structural and Functional Genomics 17 ( 4 ) 69 - 81 2016年 [査読有り]
Special issue: big data analyses in structural and functional genomics
Yokoyama, S., Yura, K.
Journal of Structural and Functional Genomics 17 ( 4 ) 67 - 67 2016年 [査読有り]
Candidate key genes for low-salinity adaptation identified by RNA-seq comparison between closely related Ulva species in marine and brackish waters.
Algal Resources 9: 61-76. 2016年 [査読有り]
Complete genome sequence of the mitochondrial DNA of the river lamprey, Lethenteron japonicum
Kawai, Y.L., Yura, K., Shindo, M., Kusakabe, R., Hayashi, K., Hata, K., Nakabayashi, K., Okamura, K.
Mitochondrial DNA 26 ( 6 ) 863 - 864 2015年 [査読有り]
Kamijyo, A., Yura, K., Ogura, A.
Gene 555 ( 2 ) 73 - 79 2015年 [査読有り]
Hori-Tanaka, Y., Yura, K., Takai-Igarashi, T., Tanaka, H.
Steroids 96 81 - 88 2015年 [査読有り]
Hijikata, A., Yura, K., Ohara, O., Go, M.
Meta Gene 4 92 - 106 2015年 [査読有り]
Biochemical analysis of phytolacca DOPA dioxygenase
Takahashi, K., Yoshida, K., Yura, K., Ashihara, H., Sakuta, M.
Natural Product Communications 10 ( 5 ) 717 - 719 2015年 [査読有り]
Inoue, K., Urushibara, K., Kanai, M., Yura, K., Fujii, S., Ishigami-Yuasa, M., Hashimoto, Y., Mori, S., Kawachi, E., Matsumura, M., Hirano, T., Kagechika, H., Tanatani, A.
European Journal of Medicinal Chemistry 102 310 - 319 2015年 [査読有り]
A Computational Study on the Role of a Methionine at a Discriminator Site of Cyclobutane-Pyrimidine-Dimer Photolyase
Sato Ryuma, Kitoh-Nishioka Hirotaka, Kawatsu Tsutomu, Yura Kei, Ando Koji, Yamato Takahisa
BIOPHYSICAL JOURNAL 106 ( 2 ) 690A 2014年01月 [査読有り]
Structural insights of post-translational modification sites in the proteome of Thermus thermophilus
Masui, R., Takahata, Y., Inoue, M., Iio, Y., Okanishi, H., Kim, K., Nakagawa, N., Yura, K., Kuramitsu, S.
Journal of structural and functional genomics 15 ( 3 ) 137 - 151 2014年 [査読有り]
Cephalopod eye evolution was modulated by the acquisition of Pax-6 splicing variants
Yoshida, M.-A., Yura, K., Ogura, A.
Scientific Reports 4 4256 2014年 [査読有り]
Kuppuraj, G., Kruise, D., Yura, K.
Journal of Physical Chemistry B 118 ( 47 ) 13486 - 13497 2014年 [査読有り]
Structure of the Microtubule-Binding Domain of Flagellar Dynein
Kato, Y.S., Yagi, T., Harris, S.A., Ohki, S.-Y., Yura, K., Shimizu, Y., Honda, S., Kamiya, R., Burgess, S.A., Tanokura, M.
Structure 22 ( 11 ) 1628 - 1638 2014年 [査読有り]
Sato Ryuma, Kitoh-Nishioka Hirotaka, Kawatsu Tsutomu, Yura Kei, Ando Koji, Yamato Takahisa
生物物理 54 ( 1 ) S236 2014年
Distinct conformation of ATP molecule in solution and on protein
Kobayashi, E., Yura, K., Nagai, Y.
Biophysics (Japan) 9 1 - 12 2013年 [査読有り]
Takai, T., Higaki, K., Aguilar-Moncayo, M., Mena-Barragán, T., Hirano, Y., Yura, K., Yu, L., Ninomiya, H., García-Moreno, M.I., Sakakibara, Y., Ohno, K., Nanba, E., Ortiz Mellet, C., García Fernández, J.M., Suzuki, Y.
Molecular Therapy 21 ( 3 ) 526 - 532 2013年 [査読有り]
Terui, H., Akagi, K., Kawame, H., Yura, K.
Journal of Biomedical Science 20 ( 1 ) 25 2013年 [査読有り]
Hoshina, S., Yura, K., Teranishi, H., Kiyasu, N., Tominaga, A., Kadoma, H., Nakatsuka, A., Kunichika, T., Obuse, C., Waga, S.
Journal of Biological Chemistry 288 ( 42 ) 30161 - 30171 2013年 [査読有り]
Yamato, T., Yura, K.
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society 85 ( 8 ) 646 - 655 2013年 [査読有り]
Terui, H., Tachikawa, T., Kakuta, M., Nishimura, Y., Yatsuoka, T., Yamaguchi, K., Yura, K., Akagi, K.
Oncology Reports 30 ( 6 ) 2909 - 2916 2013年 [査読有り]
1P270 mRNA切断ポリアデニル化特異因子複合体構成サブユニットの四次構造推定(22A. 生命情報科学:構造ゲノミクス,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))
Aoto Saki, Yura Kei
生物物理 53 ( 1 ) S150 2013年
1P269 タンパク質における分子トンネルの高速簡易探索法の開発 : トリプトファン合成酵素への適用(22A. 生命情報科学:構造ゲノミクス,ポスター,日本生物物理学会年会第51回(2013年度))
Yano Midori, Yura Kei
生物物理 53 ( 1 ) S150 2013年
Aguilar-Moncayo, M., Takai, T., Higaki, K., Mena-Barragán, T., Hirano, Y., Yura, K., Li, L., Yu, Y., Ninomiya, H., García-Moreno, M.I., Ishii, S., Sakakibara, Y., Ohno, K., Nanba, E., Ortiz Mellet, C., García Fernández, J.M., Suzuki, Y.
Chemical Communications 48 ( 52 ) 6514 - 6516 2012年 [査読有り]
Hijikata, A., Yura, K., Noguti, T., Go, M.
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics 79 ( 6 ) 1868 - 1877 2011年 [査読有り]
Yura, K., Shionyu, M., Toh, H.
Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme 54 ( 12 Suppl ) 1535 - 1541 2009年 [査読有り]
Yura, K., Hayward, S.
Bioinformatics 25 ( 23 ) 3108 - 3113 2009年 [査読有り]
Yura, K., Sulaiman, S., Hatta, Y., Shionyu, M., Go, M.
Plant and Cell Physiology 50 ( 11 ) 1865 - 1873 2009年 [査読有り]
Takahisa YAMATO, Hirotaka NISHIOKA, Kei YURA
Seibutsu Butsuri 49 ( 4 ) 196 - 197 2009年 [査読有り]
ColiSNP database server mapping nsSNPs on protein structures
Kono, H., Yuasa, T., Nishiue, S., Yura, K.
Nucleic Acids Research 36 ( SUPPL. 1 ) D409 - D413 2008年 [査読有り]
Miyazawa, Y., Nishioka, H., Yura, K., Yamato, T.
Biophysical Journal 94 ( 6 ) 2194 - 2203 2008年 [査読有り]
Yamasaki, C., Murakami, K., Fujii, Y., Sato, Y., Harada, E., Takeda, J.-I., Taniya, T., Sakate, R., Kikugawa, S., Shimada, M., Tanino, M., Koyanagi, K.O., Barrero, R.A., Gough, C., Chun, H.-W., Habara, T., Hanaoka, H., Hayakawa, Y., Hilton, P.B., Kaneko, Y., Kanno, M., Kawahara, Y., Kawamura, T., Matsuya, A., Nagata, N., Nishikata, K., Noda, A.O., Nurimoto, S., Saichi, N., Sakai, H., Sanbonmatsu, R., Shiba, R., Suzuki, M., Takabayashi, K., Takahashi, A., Tamura, T., Tanaka, M., Tanaka, S., Todokoro, F., Yamaguchi, K., Yamamoto, N., Okido, T., Mashima, J., Hashizume, A., Jin, L., Lee, K.-B., Lin, Y.-C., Nozaki, A., Sakai, K., Tada, M., Miyazaki, S., Makino, T., Ohyanagi, H., Osato, N., Tanaka, N., Suzuki, Y., Ikeo, K., Saitou, N., Sugawara, H., O'Donovan, C., Kulikova, T., Whitfield, E., Halligan, B., Shimoyama, M., Twigger, S., Yura, K., Kimura, K., Yasuda, T., Nishikawa, T., Akiyama, Y., Motono, C., Mukai, Y., Nagasaki, H., Suwa, M., Horton, P., Kikuno, R., Ohara, O., Lancet, D., Eveno, E., Graudens, E., Imbeaud, S., Debily, M.A., Hayashizaki, Y., Amid, C., Han, M., Osanger, A., Endo, T., Thomas, M.A., Hirakawa, M., Makalowski, W., Nakao, M., Kim, N.-S., Yoo, H.-S., De Souza, S.J., De Fatima Bonaldo, M., Niimura, Y., Kuryshev, V., Schupp, I., Wiemann, S., Bellgard, M., Shionyu, M., Jia, L., Thierry-Mieg, D., Thierry-Mieg, J., Wagner, L., Zhang, Q., Go, M., Minoshima, S., Ohtsubo, M., Hanada, K., Tonellato, P., Isogai, T., Zhang, J., Lenhard, B., Kim, S., Chen, Z., Hinz, U., Estreicher, A., Nakai, K., Makalowska, I., Hide, W., Tiffin, N., Wilming, L., Chakraborty, R., Soares, M.B., Chiusano, M.L., Suzuki, Y., Auffray, C., Yamaguchi-Kabata, Y., Itoh, T., Hishiki, T., Fukuchi, S., Nishikawa, K., Sugano, S., Nomura, N., Tateno, Y., Imanishi, T., Gojobori, T.
Nucleic Acids Research 36 ( SUPPL. 1 ) D793 - D799 2008年 [査読有り]
Matsumoto, A., Kamata, T., Takagi, J., Iwasaki, K., Yura, K.
Biophysical Journal 95 ( 6 ) 2895 - 2908 2008年 [査読有り]
Yura, K., Go, M.
BMC Plant Biology 8 79 2008年 [査読有り]
Yura, K., Miyata, Y., Arikawa, T., Higuchi, M., Sugita, M.
DNA Research 15 ( 5 ) 309 - 321 2008年 [査読有り]
Yura, K.
Yakugaku Zasshi 128 ( 11 ) 1547 - 1555 2008年 [査読有り]
3P-289 植物オルガネラにおけるRNAエディティング部位とタンパク質立体構造との相関関係(生命情報科学・機能ゲノミクス,第46回日本生物物理学会年会)
Go Mitiko, Yura Kei
生物物理 48 S172 2008年
3P-290 ナンジャモンジャゴケ葉緑体のRNAエディティング部位の同定と予測(生命情報科学・機能ゲノミクス,第46回日本生物物理学会年会)
Yura Kei, Miyata Yuki, Arikawa Tomotsugu, Higuchi Masanobu, Sugita Mamoru
生物物理 48 S172 2008年
Kinoshita, K., Kono, H., Yura, K.
Prediction of Protein Structures, Functions, and Interactions 159 - 186 2008年 [査読有り]
BAAQ: An infrastructure for application integration and knowledge discovery in bioinformatics
Gong, X., Nakamura, K., Yu, H., Yura, K., Go, N.
IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine 11 ( 4 ) 428 - 434 2007年 [査読有り]
S08I4 タンパク質立体構造情報と分子進化情報にもとづく生体高分子相互作用部位の推定(構造プロテオミクスを推進するバイオインフォマティクス,シンポジウム,第45回日本生物物理学会年会)
由良 敬, Kim Oanh TP, 郷 信広
生物物理 47 S12 2007年
Contribution of computational biology and structural genomics to understand genome and transcriptome
Mitiko Go, Kei Yura, Masafumi Shionyu
FRONTIERS OF COMPUTATIONAL SCIENCE 75 - + 2007年 [査読有り]
Shionyu Masafumi, Yura Kei, Go Mitiko
生物物理 46 ( 2 ) S266 2006年
Het-PDB Navi.: A Database for Protein-Small Molecule Interactions
Yamaguchi, A., Iida, K., Matsui, N., Tomoda, S., Yura, K., Go, M.
Journal of Biochemistry 135 ( 1 ) 79 - 84 2004年 [査読有り]
Kaneko, S., Ichinose, H., Fujimoto, Z., Kuno, A., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Kusakabe, I., Kobayashi, H.
Journal of Biological Chemistry 279 ( 25 ) 26619 - 26626 2004年 [査読有り]
Kim, T.P., Yura, K., Go, N., Harumoto, T.
Journal of Eukaryotic Microbiology 51 ( 3 ) 338 - 338 2004年
Kim, O.T.P., Yura, K., Go, N., Harumoto, T.
Journal of Eukaryotic Microbiology 51 ( 4 ) 495 - 495 2004年
Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones
Imanishi, T., Itoh, T., Suzuki, Y., O'Donovan, C., Fukuchi, S., Koyanagi, K.O., Barrero, R.A., Tamura, T., Yamaguchi-Kabata, Y., Tanino, M., Yura, K., Miyazaki, S., Ikeo, K., Homma, K., Kasprzyk, A., Nishikawa, T., Hirakawa, M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Ashurst, J., Jia, L., Nakao, M., Thomas, M.A., Mulder, N., Karavidopoulou, Y., Jin, L., Kim, S., Yasuda, T., Lenhard, B., Eveno, E., Suzuki, Y., Yamasaki, C., Takeda, J.-I., Gough, C., Hilton, P., Fujii, Y., Sakai, H., Tanaka, S., Amid, C., Bellgard, M., de Fatima Bonaldo, M., Bono, H., Bromberg, S.K., Brookes, A.J., Bruford, E., Carninci, P., Chelala, C., Couillault, C., de Souza, S.J., Debily, M.-A., Devignes, M.-D., Dubchak, I., Endo, T., Estreicher, A., Eyras, E., Fukami-Kobayashi, K., Gopinath, G.R., Graudens, E., Hahn, Y., Han, M., Han, Z.-G., Hanada, K., Hanaoka, H., Harada, E., Hashimoto, K., Hinz, U., Hirai, M., Hishiki, T., Hopkinson, I., Imbeaud, S., Inoko, H., Kanapin, A., Kaneko, Y., Kasukawa, T., Kelso, J., Kersey, P., Kikuno, R., Kimura, K., Korn, B., Kuryshev, V., Makalowska, I., Makino, T., Mano, S., Mariage-Samson, R., Mashima, J., Matsuda, H., Mewes, H.-W., Minoshima, S., Nagai, K., Nagasaki, H., Nagata, N., Nigam, R., Ogasawara, O., Ohara, O., Ohtsubo, M., Okada, N., Okido, T., Oota, S., Ota, M., Ota, T., Otsuki, T., Piatier-Tonneau, D., Poustka, A., Ren, S.-X., Saitou, N., Sakai, K., Sakamoto, S., Sakate, R., Schupp, I., Servant, F., Sherry, S., Shiba, R., Shimizu, N., Shimoyama, M., Simpson, A.J., Soares, B., Steward, C., Suwa, M., Suzuki, M., Takahashi, A., Tamiya, G., Tanaka, H., Taylor, T., Terwilliger, J.D., Unneberg, P., Veeramachaneni, V., Watanabe, S., Wilming, L., Yasuda, N., Hyang-Yoo, S., Stodolsky, M., Makalowski, W., Go, M., Nakai, K., Takagi, T., Kanehisa, M., Sakaki, Y., Quackenbush, J., Okazaki, Y., Hayashizaki, Y., Hide, W., Chakraborty, R., Nishikawa, K., Sugawara, H., Tateno, Y., Chen, Z., Oishi, M., Tonellato, P., Apweiler, R., Okubo, K., Wagner, L., Wiemann, S., Strausberg, R.L., Isogai, T., Auffray, C., Nomura, N., Gojobori, T., Sugano, S.
PLoS Biology 2 ( 6 ) e162 2004年 [査読有り]
3D-keynote: genome function prediction based on protein module
Yura, K., Go, M.
Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme 47 ( 8 Suppl ) 1090 - 1096 2002年 [査読有り]
Kaneko, S., Iwamatsu, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Sato, Y., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Taira, K., Hasegawa, T., Kusakabe, I., Hayashi, K.
Protein Engineering 13 ( 12 ) 873 - 879 2000年
Protein folding and genome evolution
M Go, K Yura
OLD AND NEW VIEWS OF PROTEIN FOLDING 1194 239 - 248 1999年 [査読有り]
Kaneko, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Shimizu, D., MacHida, S., Sato, Y., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Taira, K., Kusakabe, I., Hayashi, K.
FEBS Letters 460 ( 1 ) 61 - 66 1999年 [査読有り]
Module structure and function of glutamyl-tRNA synthetase
M Tateno, M Mizutani, K Yura, O Nureki, S Yokoyama, M Go
TRACING BIOLOGICAL EVOLUTION IN PROTEIN AND GENE STRUCTURES 53 - 63 1995年 [査読有り]
Helix-turn-helix module distribution and module shuffling
K Yura, M Go
TRACING BIOLOGICAL EVOLUTION IN PROTEIN AND GENE STRUCTURES 187 - 195 1995年 [査読有り]
Nakashima, T., Sekiguchi, T., Sunamoto, H., Yura, K., Tomoda, S., Go, M., Kere, J., Schlessinger, D., Nishimoto, T.
Gene 148 ( 2 ) 375 - 375 1994年 [査読有り]
Repeat of a helix–turn–helix module in DNA-binding proteins
Go, M., Yura, K., Tomoda, S.
Protein Engineering, Design and Selection 6 ( 6 ) 621 - 628 1993年 [査読有り]
実験医学別冊 創薬研究のための相互作用解析パーフェクト
由良 敬, 鈴木 博文, 栗栖 源嗣, 川端 猛, 木下 賢吾, 白井 剛, 土方 敦司, 田之倉 優( 担当: 共著)
羊土社 2021年12月
ニューバイオフィジックス 2 遺伝子の構造生物学(共著)
共立出版 1998年
Helix-turn-helix module distribution and module shuffling.(共著)
Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures 1995年
Module Structure and Function of Glutamyl-tRNA Synthetase.(共著)
Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures 1995年
Some remark on protein folding(共著)
Protein Structural Analysis, Folding and Design 1990年
低分解能生体分子像からの原子構造構築技法
JST戦略的創造研究推進制度(研究チーム型) (戦略的基礎研究推進事業:CREST)
研究期間:
DNA損傷修復関連タンパク質の構造と機能
補助金
研究期間:
ゲノムからの蛋白質 構造 機能予測
科学研究費補助金
研究期間:
蛋白質分子の構造, 機能及び進化
その他の研究制度
研究期間:
Structure, function and evolution of protein
Ordinary Research
佐々木 元子, 川目 裕, 松尾 真理, 小杉 眞司, 櫻井 晃洋, 由良 敬, 高島 響子, 李 怡然, 松川 愛未, 大住 理沙, 神原 容子, 三宅 秀彦
日本遺伝カウンセリング学会誌 43 ( 2 ) 144 - 144 2022年06月
タイワンエンマコオロギのゲノム全塩基配列解読:大量生産に向けた高効率品種改良技術の幕開け
片岡孝介, 嶺井隆平, 井手圭吾, 井手圭吾, 小倉淳, 竹山春子, 竹山春子, 竹田真木生, 鈴木丈詞, 由良敬, 由良敬, 由良敬, 朝日透
日本応用動物昆虫学会大会講演要旨 64th 2020年
レチナールを結合するリジンを保存しない微生物型ロドプシンの光応答性機能獲得
YAMAUCHI Yumeka, KONNO Masae, YAMADA Daichi, YAMADA Daichi, YURA Kei, YURA Kei, INOUE Keiichi, INOUE Keiichi, BEJA Oded, KANDORI Hideki
生物物理(Web) 59 ( Supplement 1-2 ) 2019年
ヒトおよびアカゲザルCpGアイランドプロモータの配列比較解析
青砥 早希, 伏見 麻由, 由良 敬, 岡村 浩司
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2016年 [査読有り]
研究発表ペーパー・要旨(全国大会,その他学術会議)
TafazzinトランスアシラーゼドメインにおけるBarth症候群関連変異と選択的スプライシングの構造および機能に対する影響
土方 敦司, 由良 敬, 小原 收, 郷 通子
日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [4T18p - 03(3P1259)] 2015年12月
29pAA-8 DNA光回復酵素の反応機構と活性部位の構造安定化因子(29pAA 生物物理2,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理))
佐藤 竜馬, 鬼頭-西岡 宏任, 河津 励, 由良 敬, 安藤 耕司, 倭 剛久
日本物理学会講演概要集 69 ( 1 ) 415 - 415 2014年03月
蛋白質ポケットとアミノ酸間の距離分布分析 (映像表現&コンピュータグラフィックス 映像表現・芸術科学フォーラム2013)
三好 真紀子, 伊藤 貴之, 由良 敬
映像情報メディア学会技術報告 = ITE technical report 37 ( 17 ) 243 - 246 2013年03月
理論計算+生命情報学で初めて見いだされた機能性残基―DNA 補修酵素の場合―
倭 剛久, 西岡 宏任, 由良 敬
生物物理 49 ( 4 ) 196 - 197 2009年 [招待有り]
記事・総説・解説・論説等(学術雑誌)
ダイニン微小管結合部位の構造と機能
加藤 有介, 八木 俊樹, 大木 進野, 由良 敬, 清水 洋輔, 本田 真也, 神谷 律, 田之倉 優
バイオイメージング 17 ( 2 ) 204 - 205 2008年10月
ダイニン微小管結合部位の構造と機能
加藤 有介, 八木 俊樹, 大木 進野, 由良 敬, 清水 洋輔, 本田 真也, 神谷 律, 田之倉 優
バイオイメージング 17 ( 2 ) 98 - 99 2008年10月
20pWE-2 DNA光補修酵素の電子移動反応と機能(20pWE 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))
倭 剛久, 西岡 宏任, 由良 敬
日本物理学会講演概要集 63 ( 2 ) 302 - 302 2008年08月
Comparative analysis of ribosome atomic structures deduced computationally from EM images and X-ray structures
Hisashi Ishida, Yu Tsutsumi, Atsushi Matsumoto, Kei Yura
BIOPHYSICAL JOURNAL 508A - 508A 2007年01月
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
Structural analysis of ribosome based on the elastic network normal mode analysis
Atsushi Matsumoto, Yu Tsutsumi, Kei Yura, Hisashi Ishida
BIOPHYSICAL JOURNAL 508A - 508A 2007年01月
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
Yura, K., Yamaguchi, A., Go, M.
Journal of Structural and Functional Genomics 7 ( 2 ) 65 - 76 2006年
Kim, O.T.P., Yura, K., Go, N.
Nucleic Acids Research 34 ( 22 ) 6450 - 6460 2006年
Alternative splicing in human transcriptome: Functional and structural influence on proteins
Yura, K., Shionyu, M., Hagino, K., Hijikata, A., Hirashima, Y., Nakahara, T., Eguchi, T., Shinoda, K., Yamaguchi, A., Takahashi, K.-i., Itoh, T., Imanishi, T., Gojobori, T., Go, M.
Gene 380 ( 2 ) 63 - 71 2006年
Takeda, J.-I., Suzuki, Y., Nakao, M., Barrero, R.A., Koyanagi, K.O., Jin, L., Motono, C., Hata, H., Isogai, T., Nagai, K., Otsuki, T., Kuryshev, V., Shionyu, M., Yura, K., Go, M., Thierry-Mieg, J., Thierry-Mieg, D., Wiemann, S., Nomura, N., Sugano, S., Gojobori, T., Iman ishi, T.
Nucleic Acids Research 34 ( 14 ) 3917 - 3928 2006年
Kim, O.T.P., Yura, K., Go, N., Harumoto, T.
Gene 352 ( 1-2 ) 137 - 137 2005年
タンパク質フォールディング--自己組織化と遺伝子のスプライシングから迫る (Special Issue【特集】 DNA,タンパク質の自己組織化)
郷 通子, 由良 敬
バイオニクス 2 ( 1 ) 38 - 43 2005年01月
Sequence analysis of the gliding protein Gli349 in Mycoplasma mobile
Metsugi, S, Uenoyama, A, Adan, J, Miyata, M, Yura, K, Kono, H, Go, N
BIOPHYSICS 1 33 - 43 2005年
Kim, O.T.P., Yura, K., Go, N., Harumoto, T.
Gene 346 277 - 286 2005年
Highly divergent actins from karyorelictean, heterotrich, and litostome ciliates (vol 51, pg 227, 2004)
OTP Kim, K Yura, N Go, T Harumoto
JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY 51 ( 4 ) 495 - 495 2004年07月
その他
Integrative annotation of 21,037 human genes validated by full-length cDNA clones
T Imanishi, T Itoh, Y Suzuki, C O'Donovan, S Fukuchi, KO Koyanagi, RA Barrero, T Tamura, Y Yamaguchi-Kabata, M Tanino, K Yura, S Miyazaki, K Ikeo, K Homma, A Kasprzyk, T Nishikawa, M Hirakawa, J Thierry-Mieg, D Thierry-Mieg, J Ashurst, LB Jia, M Nakao, MA Thomas, N Mulder, Y Karavidopoulou, LH Jin, S Kim, T Yasuda, B Lenhard, E Eveno, Y Suzuki, C Yamasaki, J Takeda, C Gough, P Hilton, Y Fujii, H Sakai, S Tanaka, C Amid, M Bellgard, MD Bonaldo, H Bono, SK Bromberg, AJ Brookes, E Bruford, P Carninci, C Chelala, C Couillault, SJ de Souza, MA Debily, MD Devignes, Dubchak, I, T Endo, A Estreicher, E Eyras, K Fukami-Kobayash, GR Gopinath, E Graudens, Y Hahn, M Han, ZG Han, K Hanada, H Hanaoka, E Harada, K Hashimoto, U Hinz, M Hirai, T Hishiki, Hopkinson, I, S Imbeaud, H Inoko, A Kanapin, Y Kaneko, T Kasukawa, J Kelso, P Kersey, R Kikuno, K Kimura, B Korn, Kuryshev, V, Makalowska, I, T Makino, S Mano, R Mariage-Samson, J Mashima, H Matsuda, HW Mewes, S Minoshima, K Nagai, H Nagasaki, N Nagata, R Nigam, O Ogasawara, O Ohara, M Ohtsubo, N Okada, T Okido, S Oota, M Ota, T Ota, T Otsuki, D Piatier-Tonneau, A Poustka, SX Ren, N Saitou, K Sakai, S Sakamoto, R Sakate, Schupp, I, F Servant, S Sherry, R Shiba, N Shimizu, M Shimoyama, AJ Simpson, B Soares, C Steward, M Suwa, M Suzuki, A Takahashi, G Tamiya, H Tanaka, T Taylor, JD Terwilliger, P Unneberg, Veeramachaneni, V, S Watanabe, L Wilming, N Yasuda, HS Yoo, M Stodolsky, W Makalowski, M Go, K Nakai, T Takagi, M Kanehisa, Y Sakaki, J Quackenbush, Y Okazaki, Y Hayashizaki, W Hide, R Chakraborty, K Nishikawa, H Sugawara, Y Tateno, Z Chen, M Oishi, P Tonellato, R Apweiler, K Okubo, L Wagner, S Wiemann, RL Strausberg, T Isogai, C Auffray, N Nomura, T Gojobori, S Sugano
PLOS BIOLOGY 2 ( 6 ) 856 - 875 2004年06月
書評論文,書評,文献紹介等
Highly divergent actins from karyorelictean, heterotrich, and litostome ciliates (vol 51, pg 227, 2004)
OTP Kim, K Yura, N Go, T Harumoto
JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY 51 ( 3 ) 338 - 338 2004年05月
その他
28aYE-8 転写システムに注目したゲノム機能予測(領域9,領域12合同シンポジウム : バイオクリスタリゼーション,構造ゲノム科学,バイオインフォマティクス〜その3重点に出現する新phaseの発見〜)
由良 敬, 河野 秀俊, 郷 信広
日本物理学会講演概要集 59 ( 1 ) 366 - 366 2004年03月
ビタミン、ミネラルのかたち 「食品の科学」 (上野川修一、田之倉優 編集)
東京化学同人 2004年02月
Het-PDB Navi.: A database for protein-small molecule interactions
A Yamaguchi, K Iida, N Matsui, S Tomoda, K Yura, M Go
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 135 ( 1 ) 79 - 84 2004年01月
Highly divergent actins from Karyorelictean, Heterotrich, and Litostome Ciliates
Kim, O.T.P., Yura, K., Nobuhiro, G.O., Harumoto, T.
Journal of Eukaryotic Microbiology 51 ( 2 ) 227 - 233 2004年
Het-PDB Navi.: A database for protein-small molecule interactions
A Yamaguchi, K Iida, N Matsui, S Tomoda, K Yura, M Go
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 135 ( 1 ) 79 - 84 2004年01月
Enlarged FAMSBASE: Protein 3D structure models of genome sequences for 41 species
Yamaguchi, A., Iwadate, M., Suzuki, E.-I., Yura, K., Kawakita, S., Umeyama, H., Go, M.
Nucleic Acids Research 31 ( 1 ) 463 - 468 2003年
タンパク質立体構造の進化「ゲノムからみた生物の多様性と進化」 (五條堀孝 編集)
シュプリンガー・フェアラーク 33-40 2003年
Novel types of two-domain multi-copper oxidases: Possible missing links in the evolution
Nakamura, K., Kawabata, T., Yura, K., Go, N.
FEBS Letters 553 ( 3 ) 239 - 244 2003年
データベース構築と構造バイオインフォマティクス モジュールに基づくゲノム機能予測--3Dキーノート (蛋白質ネットワークの構造生物学) -- (第2部 構造プロテオミクスにおける最新技術)
由良 敬, 郷 通子
蛋白質核酸酵素 47 ( 8 ) 1090 - 1096 2002年06月
モジュールに基づくゲノム機能予測 蛋白質核酸酵素増刊「構造プロテオミクス」
共立出版 ( 47 ) 1090 - 1096 2002年
ゲノム配列にもとづくタンパク質機能予測 「プロテオミクスの最新技術」深見泰夫監修
ジーエムシー出版 93-101 2002年
Yoshihara, S., Geng, X.X., Okamoto, S., Yura, K., Murata, T., Go M., Ohmori, M., and ikeuchi, M.: Mutational analysis of genes involved in pilus structure, motility and transformation competency in the unicelluular motile cyanobacterium Synechocystis s・・・
YOSHIHARA S, GENG X X, OKAMOTO S, YURA K, MURATA T, GO M, OHMORI M, IKEUCHI M
<i>Plant Cell Physiol</i> 42 ( 1 ) 63 - 73 2001年01月
Capacity of thermomonospora alba Xy1A to impart thermostability in family F/10 chimeric xylanases
Ahsan, M.M., Kaneko, S., Wang, Q., Yura, K., Go, M., Hayash, K.
Enzyme and Microbial Technology 28 ( 1 ) 8 - 15 2001年
ジンクフィンガードメイン.「生体の化学:モチーフ・ドメインリスト」金原一郎記念医学医療振興財団
医学書院 394-395 2001年
POUドメイン. 「生体の化学:モチーフ・ドメインリスト」金原一郎記念医学医療振興財団
医学書院 384-385 2001年
Yoshihara, S., Geng, X.X., Okamoto, S., Yura, K., Murata, T., Go, M., Ohmori, M., Ikeuchi, M.
Plant and Cell Physiology 42 ( 1 ) 63 - 73 2001年
Significance of a two-domain structure in subunits of phycobiliproteins revealed by the normal mode analysis
H Kikuchi, H Wako, K Yura, M Go, M Mimuro
BIOPHYSICAL JOURNAL 79 ( 3 ) 1587 - 1600 2000年09月
タンパク質立体構造に基づくゲノム機能予測.「ゲノム情報生物学-bio-informaticsとinformation biology」(松原謙一、榊 佳之 監修)
中山書店 100 - 115 2000年
Kaneko, S., Iwamatsu, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Sato, Y., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Taira, K., Hasegawa, T., Kusakabe, I., Hayashi, K.: Module shuffling of a family F/10 xylanase: replacement of modules M4 and M5 of the FXYN of Streptomyces oliva・・・
<i>Protein Engng</i> ( 13 ) 873 - 879 2000年
Kikuchi, H., Wako, H., Yura, K., Go, M., Mimuro, M.
Biophysical Journal 79 ( 3 ) 1587 - 1600 2000年
Kaneko, S., Iwamatsu, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Sato, Y., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Taira, K., Hasegawa, T., Kusakabe, I., Hayashi, K.: Module shuffling of a family F/10 xylanase: replacement of modules M4 and M5 of the FXYN of Streptomyces oliva・・・
<i>Protein Engng.</i> ( 13 ) 873 - 879 2000年
Module-intron correlation and intron sliding in family F/10 xylanase genes
Y Sato, Y Niimura, K Yura, M Go
GENE 238 ( 1 ) 93 - 101 1999年09月
Putative mechanism of natural transformation as deduced from genome data
Yura, K., Toh, H., Go, M.
DNA Research 6 ( 2 ) 75 - 82 1999年
Kaneko, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Shimizu, D., Machida, S., Sato, Y., Yura, K., Go, M.,Mizuno, H., Taira, K., Kusakabe, I. and Hayashi, K.: An investigation of the nature and function of module 10 in a family F/10 xylanase FXYN of Streptomyces olivac・・・
<i>FEBS letters</i> ( 460 ) 61 - 66 1999年
Go, M. and Yura, K.: Protein Folding and Genome Evolution in "Old and New Views of Protein Folding(eds. Kuwajima, K. and Arai, M.)
Elsevier 239 - 248 1999年
Kaneko, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Shimizu, D., Machida, S., Sato, Y., Yura, K., Go, M.,Mizuno, H., Taira, K., Kusakabe, I. and Hayashi, K.: An investigation of the nature and function of module 10 in a family F/10 xylanase FXYN of Streptomyces olivac・・・
<i>FEBS letters</i> ( 460 ) 61 - 66 1999年
Module-intron correlation and intron sliding in family F/10 xylanase genes
Sato, Y., Niimura, Y., Yura, K., Go, M.
Gene 238 ( 1 ) 93 - 101 1999年
Go, M. and Yura, K.: Protein Folding and Genome Evolution in "Old and New Views of Protein Folding(eds. Kuwajima, K. and Arai, M.)
Elsevier 239 - 248 1999年
Yura, K., Shionyu, M., Kawatani, K., Go, M.
Cellular and Molecular Life Sciences 55 ( 3 ) 472 - 486 1999年
4つの転写因子におけるモジュールとイントロンの相関
由良 敬, 塩生 真史, 橋本 博之, 郷 通子
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 280 - 280 1998年12月
モジュールの分類にもとづく機能部位予測-RNAポリメラーゼαCTDのDNA結合様式
由良 敬, 郷 通子
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 281 - 281 1998年12月
Streptomyces olivaceoviridisとThermomonospora alba由来のキシラナーゼ遺伝子のシャッフリングとキメラ酵素の特性解析
MOHAMMAD Mainul ahsan, 金子 哲, ANISUR Rahman khan, 王 沁, 日下部 功, 佐藤 陽子, 由良 敬, 郷 通子, 林 清
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 326 - 326 1998年12月
モジュール置換によるキメラキシラナーゼの構築と構造機能相関の解明
金子哲, 久野敦, 清水大輔, 佐藤陽子, 由良敬, 郷通子, 日下部功, 多比良和誠, 林清
日本農芸化学会関東支部受賞記念講演およびシンポジウム講演要旨集 1998 ( Oct ) 9 1998年10月
郷 通子、由良 敬: 相互作用と構造ブロック.「遺伝子の構造生物学」〈嶋本伸雄、郷 通子 編集)
共立出版 169 - 179 1998年
Yura, K. and Go, M.: The homeodomain-like putative product of plastid genome: A possible role in plastid differentiation.
<i>Res. Comm. Biochem. Cell & Mol. Biol.</i> ( 1 ) 79 - 81 1997年
由良 敬、篠田和紀、井本剛史、郷 通子: DNA塩基配列を用いたfastDNAmlによる進化系統樹の推定
由良 敬, 篠田 和紀, 井本 剛史, 郷 通子
名古屋大学大型計算機センターニュース 28 ( 28 ) 127 - 135 1997年
Yura, K. and Go, M.: The homeodomain-like putative product of plastid genome: A possible role in plastid differentiation.
<i>Res. Comm. Biochem. Cell & Mol. Biol.</i> ( 1 ) 79 - 81 1997年
The homeodomain-like putative product of plastid genome : A possible role in plastid differentiation(共著)
Research Communication of Biochemistry, Cell and Molecular Biology 1 ( 1 ) 79 1997年
DNA phosphate-binding module: A new building unit for DNA-binding protein
K Yura, K Kawatani, M Go
PROTEIN ENGINEERING 9 ( 9 ) 9 - 9 1996年09月
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
トリオースリン酸イソメラーゼのモジュール境界とイントロン位置の相関
灘浪 和彦, 由良 敬, 本多 光雄, 野口 俊之, 郷 通子
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 737 - 737 1996年08月
A newly identified phosphate-binding module in DNA-binding proteins
K Yura, K Kawatani, M Go
PROGRESS IN BIOPHYSICS & MOLECULAR BIOLOGY 65 PA205 - PA205 1996年
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
Statistical evidence of intron-module correlation in glycolytic enzymes and origin of introns
M Go, T Noguti, K Yura
PROGRESS IN BIOPHYSICS & MOLECULAR BIOLOGY 65 PA206 - PA206 1996年
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
Molecular recognition mechanism of tRNA(Glu) by glutamyl-tRNA synthetase: A study using molecular dynamics simulation and computer modeling
M Tateno, O Nureki, K Yura, K Morikawa, T Noguti, S Yokoyama, M Go
PROTEIN ENGINEERING 8 ( 9 ) 47 - 47 1995年09月
研究発表ペーパー・要旨(国際会議)
Tateno, M., Mizutai, M., Yura K., Nureki, O., Yokoyama, S., Go, M. Modules Structure and Function of Glutamyl-tRNA Synthetase. in "Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures"(eds. M.Go and P. Schimmel)
Elsevier 53 - 64 1995年
Yura, K. and Go, M.: Helix-turn-helix module distribution and module shuffing. in "Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures"(eds. M. Go and P. Schimmel)
Elsevier 187 - 196 1995年
Tateno, M., Mizutai, M., Yura K., Nureki, O., Yokoyama, S., Go, M. Modules Structure and Function of Glutamyl-tRNA Synthetase. in "Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures"(eds. M.Go and P. Schimmel)
Elsevier 53 - 64 1995年
Yura, K. and Go, M.: Helix-turn-helix module distribution and module shuffing. in "Tracing Biological Evolution in Protein and Gene Structures"(eds. M. Go and P. Schimmel)
Elsevier 187 - 196 1995年
STRUCTURE OF THE HUMAN CCGI GENE - RELATIONSHIP BETWEEN THE EXONS/INTRONS AND FUNCTIONAL DOMAIN/MODULES OF THE PROTEIN (VOL 141, PG 193, 1994)
T NAKASHIMA, T SEKIGUCHI, H SUNAMOTO, K YURA, S TOMODA, M GO, J KERE, D SCHLESSINGER, T NISHIMOTO
GENE 148 ( 2 ) 375 - 375 1994年10月
その他
STRUCTURE OF THE HUMAN CCG1 GENE - RELATIONSHIP BETWEEN THE EXONS INTRONS AND FUNCTIONAL DOMAIN MODULES OF THE PROTEIN
T NAKASHIMA, T SEKIGUCHI, H SUNAMOTO, K YURA, S TOMODA, M GO, J KERE, D SCHLESSINGER, T NISHIMOTO
GENE 141 ( 2 ) 193 - 200 1994年04月
STRUCTURE OF THE HUMAN CCG1 GENE - RELATIONSHIP BETWEEN THE EXONS INTRONS AND FUNCTIONAL DOMAIN MODULES OF THE PROTEIN
T NAKASHIMA, T SEKIGUCHI, H SUNAMOTO, K YURA, S TOMODA, M GO, J KERE, D SCHLESSINGER, T NISHIMOTO
GENE 141 ( 2 ) 193 - 200 1994年04月
Torahiko, N., Takeshi, S., Hidetoshi, S., Kei, Y., Shirou, T., Mitiko, G., Juha, K., David, S., Takeharu, N.
Gene 141 ( 2 ) 193 - 200 1994年
ESSENTIAL ROLE OF THE ARG112 RESIDUE OF CYTOCHROME-P450CAM FOR ELECTRON-TRANSFER FROM REDUCED PUTIDAREDOXIN
H KOGA, Y SAGARA, T YAOI, M TSUJIMURA, K NAKAMURA, K SEKIMIZU, R MAKINO, H SHIMADA, Y ISHIMURA, K YURA, M GO, M IKEGUCHI, T HORIUCHI
FEBS LETTERS 331 ( 1-2 ) 109 - 113 1993年09月
ESSENTIAL ROLE OF THE ARG112 RESIDUE OF CYTOCHROME-P450CAM FOR ELECTRON-TRANSFER FROM REDUCED PUTIDAREDOXIN
H KOGA, Y SAGARA, T YAOI, M TSUJIMURA, K NAKAMURA, K SEKIMIZU, R MAKINO, H SHIMADA, Y ISHIMURA, K YURA, M GO, M IKEGUCHI, T HORIUCHI
FEBS LETTERS 331 ( 1-2 ) 109 - 113 1993年09月
REPEAT OF A HELIX-TURN-HELIX MODULE IN DNA-BINDING PROTEINS
K YURA, S TOMODA, M GO
PROTEIN ENGINEERING 6 ( 6 ) 621 - 628 1993年08月
担当区分:筆頭著者
REPEAT OF A HELIX-TURN-HELIX MODULE IN DNA-BINDING PROTEINS
K YURA, S TOMODA, M GO
PROTEIN ENGINEERING 6 ( 6 ) 621 - 628 1993年08月
REPEAT OF A HELIX-TURN-HELIX MODULE IN DNA-BINDING PROTEINS
K YURA, S TOMODA, M GO
PROTEIN ENGINEERING 6 ( 6 ) 621 - 628 1993年08月
<i>FEBS Letters</i> 331 ( 1-2 ) 109 - 113 1993年
Saito, N., Yura, K. and Fukuda, Y.:Some remarks on protein folding. in "Protein Structural Analysis, Folding and Design" (ed. M. Hatano)
Japan Sci. soc. Press and Elsevier 19 1990年
Saito, N., Yura, K. and Fukuda, Y.:Some remarks on protein folding. in "Protein Structural Analysis, Folding and Design" (ed. M. Hatano)
Japan Sci. soc. Press and Elsevier 19 1990年
International Biophysical Congress 2024 (Kyoto)
(京都)
産業経済新聞
日本生物物理学会
日本生物物理学会
World Wide Protein Data Bank (wwPDB)
附属機関・学校 グローバルエデュケーションセンター
理工学術院 大学院先進理工学研究科
理工学術院総合研究所 兼任研究員
創薬等のプロジェクトを支援するヒトゲノムアノテーションデータベースの開発
2018年 鈴木博文
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