2025/07/27 更新

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トモオカ リョウ
友岡 領
所属
人間科学学術院 人間総合研究センター
職名
研究助手
学位
博士(医学) ( 2025年03月 慶應義塾大学 )

経歴

  • 2025年04月
    -
    継続中

    早稲田大学   人間科学学術院   研究助手

  • 2022年04月
    -
    2025年03月

    独立行政法人日本学術振興会   特別研究員(DC1)

  • 2021年10月
    -
    2022年03月

    国立研究開発法人科学技術振興機構

    博士後期課程学生支援プロジェクト

  • 2019年04月
    -
    2021年03月

    慶應義塾大学病院   初期臨床研修医

学歴

  • 2021年04月
    -
    2025年03月

    慶應義塾大学   医学研究科  

  • 2013年04月
    -
    2019年03月

    慶應義塾大学   医学部  

研究分野

  • 分子生物学
 

論文

  • Phase separated condensates of ATRX regulate neural progenitor identity.

    Ryo Tomooka, Tsukasa Sanosaka, Tamami Miyagi, Tomoko Andoh-Noda, Satoe Banno, Noriko Mizota, Kohsuke Kanekura, Hideyuki Okano, Jun Kohyama

    Nature communications   16 ( 1 ) 6489 - 6489  2025年07月  [国際誌]

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    Mutations in the ATRX genes cause alpha-thalassemia X-linked intellectual disability (ATR-X) syndrome. Here, we show that ATRX influences the fate of human neural progenitor cells (hNPCs) by forming condensates through liquid-liquid phase separation (LLPS). The intrinsically disordered region (IDR) of ATRX is essential for LLPS and enables ATRX to form dynamic condensates that recruit co-activators. These condensates are necessary for ATRX localization at super-enhancers (SEs) in hNPCs, linking its compartmentalization to transcriptional regulation. Disruption of ATRX condensates alters gene expression and impairs neuronal differentiation. Our findings support a model in which ATRX phase separation regulates gene networks required for hNPC identity. These findings extend current understanding of ATRX function beyond its roles in chromatin structure and suggest that LLPS is a key regulatory mechanism by which ATRX supports neurodevelopment. This study opens avenues for further investigation into how dysregulation of ATRX and its phase-separation ability may contribute to the pathogenesis of ATR-X syndrome and related neurodevelopmental disorders.

    DOI PubMed

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  • Mesenchymal properties of iPSC-derived neural progenitors that generate undesired grafts after transplantation.

    Miho Isoda, Tsukasa Sanosaka, Ryo Tomooka, Yo Mabuchi, Munehisa Shinozaki, Tomoko Andoh-Noda, Satoe Banno, Noriko Mizota, Ryo Yamaguchi, Hideyuki Okano, Jun Kohyama

    Communications biology   6 ( 1 ) 611 - 611  2023年06月  [国際誌]

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    Although neural stem/progenitor cells derived from human induced pluripotent stem cells (hiPSC-NS/PCs) are expected to be a cell source for cell-based therapy, tumorigenesis of hiPSC-NS/PCs is a potential problem for clinical applications. Therefore, to understand the mechanisms of tumorigenicity in NS/PCs, we clarified the cell populations of NS/PCs. We established single cell-derived NS/PC clones (scNS/PCs) from hiPSC-NS/PCs that generated undesired grafts. Additionally, we performed bioassays on scNS/PCs, which classified cell types within parental hiPSC-NS/PCs. Interestingly, we found unique subsets of scNS/PCs, which exhibited the transcriptome signature of mesenchymal lineages. Furthermore, these scNS/PCs expressed both neural (PSA-NCAM) and mesenchymal (CD73 and CD105) markers, and had an osteogenic differentiation capacity. Notably, eliminating CD73+ CD105+ cells from among parental hiPSC-NS/PCs ensured the quality of hiPSC-NS/PCs. Taken together, the existence of unexpected cell populations among NS/PCs may explain their tumorigenicity leading to potential safety issues of hiPSC-NS/PCs for future regenerative medicine.

    DOI PubMed

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    4
    被引用数
    (Scopus)
  • Chromatin remodeler CHD7 targets active enhancer region to regulate cell type-specific gene expression in human neural crest cells.

    Tsukasa Sanosaka, Hironobu Okuno, Noriko Mizota, Tomoko Andoh-Noda, Miki Sato, Ryo Tomooka, Satoe Banno, Jun Kohyama, Hideyuki Okano

    Scientific reports   12 ( 1 ) 22648 - 22648  2022年12月  [国際誌]

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    A mutation in the chromatin remodeler chromodomain helicase DNA-binding 7 (CHD7) gene causes the multiple congenital anomaly CHARGE syndrome. The craniofacial anomalies observed in CHARGE syndrome are caused by dysfunctions of neural crest cells (NCCs), which originate from the neural tube. However, the mechanism by which CHD7 regulates the function of human NCCs (hNCCs) remains unclear. We aimed to characterize the cis-regulatory elements governed by CHD7 in hNCCs by analyzing genome-wide ChIP-Seq data and identifying hNCC-specific CHD7-binding profiles. We compared CHD7-binding regions among cell types, including human induced pluripotent stem cells and human neuroepithelial cells, to determine the comprehensive properties of CHD7-binding in hNCCs. Importantly, analysis of the hNCC-specific CHD7-bound region revealed transcription factor AP-2α as a potential co-factor facilitating the cell type-specific transcriptional program in hNCCs. CHD7 was strongly associated with active enhancer regions, permitting the expression of hNCC-specific genes to sustain the function of hNCCs. Our findings reveal the regulatory mechanisms of CHD7 in hNCCs, thus providing additional information regarding the transcriptional programs in hNCCs.

    DOI PubMed

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    5
    被引用数
    (Scopus)

共同研究・競争的資金等の研究課題

  • 新規3次元培養法を利用した神経変性疾患に対する創薬基盤の開発

    日本学術振興会  科学研究費助成事業

    研究期間:

    2023年03月
    -
    2025年03月
     

    友岡 領

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    アルツハイマー病(AD)を始めとする神経変性疾患患者は社会の高齢化に伴い増加の一途を辿っており、治療法の開発が求められている。申請者はこれまでに、疾患病態を反映したアストロサイト細胞塊(iA spheroid)の作成を可能としており、本研究はAD患者由来iA spheroidの表現系評価と臨床応用に向けた誘導法の改良を行うものである。2023年度は主に①アミロイド凝集体蛍光標識系の代替法検討と②AD患者由来iA spheroidの表現型解析を行った。
    ①当初アミロイド凝集体蛍光標識は、蛍光タンパク質を付加したアミロイドβ42(Aβ42)の強制発現ベクターの導入を計画していた。一方、ベクターによる持続的なAβ42の発現から細胞毒性が強く均一なアミロイド塊蛍光標識は困難であった。導入条件の検討と共に、外因的に蛍光標識アミロイドβの添加で代替可能か検討した。健常者およびAD患者由来iA細胞に対し蛍光標識Aβ42のプロトフィブリル体を2次元培養下で添加し、細胞への取り込みを観察した。結果、iA細胞への蛍光標識Aβ42の取り込みを確認でき、細胞死もベクター導入に比して少なかった。今後、3次元培養への移行時に蛍光標識Aβ42を添加し、細胞塊蛍光標識が可能か検討する。
    ②3次元浮遊培養法で作出されるAD患者由来iA spheroidに認められるアミロイド凝集体に対し、電子顕微鏡による追加解析を行った。透過電子顕微鏡(TEM: Transmission Electron Microscope)および免疫電子顕微鏡法(iEM: Immunoelectron microscopy)による評価を行った。結果、Aβ42抗体陽性のアミロイド線維凝集物と、それらがライソゾームに取り込まれている様子が観察できた。