Research Institute
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2021-2022
リサーチイノベ オープンイノベーション推進セクション 兼任センター員
Details of a Researcher
Updated on 2022/07/02
リサーチイノベ オープンイノベーション推進セクション 兼任センター員
2019.03 早稲田大学 工学 (Engineering)
Waseda University Research Organization for Nano & Life Innovation
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology AIST-Waseda University Comptational Bio Big-Data Open Innovation Laboratory
Japan Society for the Promotion of Science
Applied microbiology
Strain-level profiling of viable microbial community by selective single-cell genome sequencing
Masahito Hosokawa, Taruho Endoh, Kazuma Kamata, Koji Arikawa, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Haruko Takeyama
Scientific Reports 12 ( 1 ) 2022.12 [Refereed]
Hiroshi Arai, Hisashi Anbutsu, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Kazuo Ishii, Masahito Hosokawa, Shiou-Ruei Lin, Masatoshi Ueda, Madoka Nakai, Yasuhisa Kunimi, Toshiyuki Harumoto, Daisuke Kageyama, Haruko Takeyama, Maki N. Inoue
2022.06
Authorship:Lead author
Identification of Lipolytic Enzymes Using High-Throughput Single-cell Screening and Sorting of a Metagenomic Library
Amani Alma’abadi, Hayedeh Behzad, Mohammed Alarawi, David Conchouso, Yoshimoto Saito, Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Haruko Takeyama, Katsuhiko Mineta, Takashi Gojobori
New Biotechnology 2022.05 [Refereed]
Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano, Koji Kinjo, Michihiro Ito, Masahito Hosokawa, Kei Yura, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama
2022.04
Authorship:Lead author
Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Koji Arikawa, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa
2022.03
Single-cell metabolite detection and genomics reveals uncultivated talented producer
Masato Kogawa, Rimi Miyaoka, Franziska Hemmerling, Masahiro Ando, Kei Yura, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Yuji Ise, Jackson K B Cahn, Kentaro Takada, Shigeki Matsunaga, Tetsushi Mori, Jörn Piel, Haruko Takeyama
PNAS Nexus 1 ( 1 ) 2022.03 [Refereed]
Integration of Droplet Microfluidic Tools for Single-cell Functional Metagenomics: An Engineering Head Start
David Conchouso, Amani Al-Ma'abadi, Hayedeh Behzad, Mohammed Alarawi, Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Haruko Takeyama, Katsuhiko Mineta, Takashi Gojobori
Genomics, Proteomics & Bioinformatics 2021.12 [Refereed]
High-Quality Draft Genome Sequence of a Rickettsiales Bacterium Found in Acropora tenuis Coral from Okinawa, Japan.
Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Eisuke Iwamoto, Ashok Zachariah Samuel, Yoshikatsu Nakano, Haruko Takeyama
Microbiology resource announcements 9 ( 48 ) 2020.11 [International journal]
Authorship:Lead author
Draft Genome Sequence of Okeania sp. Strain KiyG1, Assembled from Single-Amplified Genomes Collected from Cape Kiyan, Okinawa, Japan.
Muhammad Wahyudin Lewaru, Yohei Nishikawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ashok Zachariah Samuel, Shinpei Sumimoto, Handung Nuryadi, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama
Microbiology resource announcements 9 ( 46 ) 2020.11 [International journal]
Authorship:Lead author
Single-cell genomics of uncultured bacteria reveals dietary fiber responders in the mouse gut microbiota.
Rieka Chijiiwa, Masahito Hosokawa, Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Keigo Ide, Chikako Sakanashi, Kai Takahashi, Haruko Takeyama
Microbiome 8 ( 1 ) 5 - 5 2020.01 [Refereed] [International journal]
High-throughput identification of peptide agonists against GPCRs by co-culture of mammalian reporter cells and peptide-secreting yeast cells using droplet microfluidics.
Kenshi Yaginuma, Wataru Aoki, Natsuko Miura, Yuta Ohtani, Shunsuke Aburaya, Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Haruko Takeyama, Mitsuyoshi Ueda
Scientific reports 9 ( 1 ) 10920 - 10920 2019.07 [Refereed] [International journal]
Correction to: A CCR5+ memory subset within HIV-1-infected primary resting CD4+ T cells is permissive for replication-competent, latently infected viruses in vitro.
Kazutaka Terahara, Ryutaro Iwabuchi, Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Haruko Takeyama, Yoshimasa Takahashi, Yasuko Tsunetsugu-Yokota
BMC research notes 12 ( 1 ) 322 - 322 2019.06 [Refereed] [International journal]
A CCR5+ memory subset within HIV-1-infected primary resting CD4+ T cells is permissive for replication-competent, latently infected viruses in vitro.
Kazutaka Terahara, Ryutaro Iwabuchi, Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Haruko Takeyama, Yoshimasa Takahashi, Yasuko Tsunetsugu-Yokota
BMC research notes 12 ( 1 ) 242 - 242 2019.04 [Refereed] [International journal]
Analysis of environmental bacteria at single-cell level
Masahito Hosokawa, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Haruko Takeyama
TRANSDUCERS 2017 - 19th International Conference on Solid-State Sensors, Actuators and Microsystems 634 - 637 2017.07 [Refereed]
Droplet-based microfluidics for high-throughput screening of a metagenomic library for isolation of microbial enzymes.
Masahito Hosokawa, Yuri Hoshino, Yohei Nishikawa, Tomotada Hirose, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Mori, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Haruko Takeyama
Biosensors & bioelectronics 67 379 - 85 2015.05 [Refereed] [International journal]
Novel insights and possibilities in single cell
( Part: Contributor, High-throughput platform for screening of novel bioactive compound producers)
2021.08
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( Part: Joint author)
2020
バイオイノベーションに向けて : バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点
植田, 充美( Part: Contributor)
シーエムシー出版 2019.03 ISBN: 9784781314112
Challenges and prospects in single-cell genomics for uncultivable bacteria
68 ( 2 ) 150 - 154 2017.03
Hosokawa Masahito, Nishikawa Yohei, Kogawa Masato, Takeyama Haruko
67 152 - 152 2015
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2016.09 The Society for Biotechnology, Japan
シングルゲノム情報を用いた水圏ファージ-宿主間の相互作用解析
国立研究開発法人科学技術振興機構(JST) 戦略的創造研究推進事業(ACT-X)
Project Year :
河川水中の薬剤耐性遺伝子の時空間的な伝播・分布を単一細胞全ゲノム情報から解明する
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究
Project Year :
西川 洋平
育種を加速するパスウェイ型シミュレータの開発とバイオデータ連携基盤構築
Project Year :
マイクロドロップレットを用いた単一微生物からの生合成遺伝子クラスターの超並列解析
日本学術振興会 科学研究費助成事業 特別研究員奨励費
Project Year :
西川 洋平
1細胞・1粒子レベルのゲノム情報から読み解く、環境細菌とファージの相互作用
西川洋平 [Invited]
バイオインフォマティクス相談部会 第五回講演会
Presentation date: 2022.03
Microfluidic droplet-based single-cell genome sequencing reveals biological diversities of environmental microbiome in the surrounding area of the Red Sea
Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Katsuhiko Mineta, Kai Takahashi, Keigo Ide, Kei Yura, Hayedeh Behzad, Takashi Gojobori, Haruko Takeyama
The 2020 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2020)
Presentation date: 2021.12
Microfluidic droplet-based single-cell genomics in aquatic and marine environments for revealing microbial and phage diversity.
Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Ryota Wagatsuma, Yuko Tsukada, Haruko Takeyama [Invited]
2021 AFOB virtual conference
Presentation date: 2021.11
河川水中の細菌・ウイルスを対象とした1細胞・1粒子レベルでのゲノム解析
西川 洋平, 我妻 竜太, 塚田 祐子, 井手 圭吾, 小川 雅人, 細川 正人, 竹山 春子
日本水処理生物学会第57回(神奈川)大会
Presentation date: 2021.10
シングルゲノム情報を用いた 水圏ファージ-宿主間の相互作用解析
西川洋平
第73回 日本生物工学会大会
Presentation date: 2021.10
Single-cell Genomics of River Water Microbiomes for Revealing the Distribution of Mobile Genetic Elements
Y. Nishikawa, Y. Tsukada, R. Wagatsuma, K. Ide, M Kogawa, M. Hosokawa, H. Takeyama
World Microbe Forum 2021
Presentation date: 2021.06
水圏環境の細菌・ファージの動態解明に向けたシングルゲノム解析
西川洋平
第21回マリンバイオテクノロジー学会大会
Presentation date: 2021.05
多摩川に存在する薬剤耐性菌のゲノム情報をシングルセルレベルで解析する
西川洋平, 小川雅人, 塚田祐子, 井手圭吾, 細川正人, 竹山春子
第55回日本水環境学会年会
Presentation date: 2021.03
紅海周辺の多様な環境微生物を対象とした大規模かつ高精度なシングルセルゲノム解析
西川洋平, 小川雅人, 細川正人, 峯田克彦, 高橋海, 坂梨千佳子, 由良敬, 井手圭吾, ベザドハイジ, 五條堀孝, 竹山春子
第43回日本分子生物学会
Presentation date: 2020.12
マイクロ流体デバイスを用いた環境細菌の高精度かつ一細胞選択的な全ゲノム解析
西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 井手圭吾, 竹山春子
電気化学会第87回大会
Presentation date: 2020.03
Development of microfluidic droplet-based whole genome amplification method for single-cell genome analysis of coral commensal bacteria; Endozoicomonas
Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Masato Kogawa, Keigo Ide, Haruko Takeyama
Marine biotechnology conference 2019
Presentation date: 2019.09
微小反応場を活用したサンゴ共在微生物の高精度なシングルセルゲノム解析
西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 井手圭吾, 竹山春子
シングルセルゲノミクス研究会2019
Presentation date: 2019.08
微小液滴作製技術を応用したサンゴ共在微生物の高精度な単一細胞ゲノム解析技術の確立
西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 井手圭吾, 竹山春子
第71回日本生物工学会大会
Presentation date: 2019.08
マイクロドロップレットを用いた網羅的な単一細胞ゲノム解析技術の開発
西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 竹山春子
第18回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
Presentation date: 2019.05
Microfluidic droplet-based whole genome amplification toward bacteria single-cell genomics
ADVANCED TECHNIQUES TO STUDY AND EXPLOIT THE SPONGE AND CORAL MICROBIOMES WORKSHOP
Presentation date: 2018.11
サンゴ共在微生物の単一細胞ゲノム解析に向けた微小液滴作成技術の応用
西川 洋平, 細川 正人, 小川 雅人, 竹田 裕貴, 丸山 徹, 竹山春子
第20回マリンバイオテクノロジー学会
Presentation date: 2018.05
Droplet microfluidics toward accurate genome sequencing of environmental bacteria at the single-cell level
NISHIKAWA, Yohei, HOSOKAWA, Masahito, KOGAWA, Masato, TAKAHASHI, Kai, TAKEYAMA, Haruko
Presentation date: 2018.03
Droplet microfluidics for massively parallel and accurate whole genome amplification of single-cells
International Symposium for Nano-Biotechnology, Chemical & Medical Biology and Robotics,
Presentation date: 2018
微小液滴を用いた単一細胞からの超並列ゲノム解析技術の開発
第69回日本生物工学会大会
Presentation date: 2017.09
マイクロ流体デバイスによる高精度な超並列1細胞ゲノム増幅技術の開発
西川 洋平, 細川 正人, 小川 雅人, 竹山 春子
NGS現場の会第5回研究会
Presentation date: 2017
マイクロドロップレットを用いた高精度な超並列1細胞ゲノム解析技術の開発
西川 洋平, 細川 正人, 小川 雅人, 竹山 春子
第11回バイオ関連化学シンポジウム
Presentation date: 2017
単一微生物からの高精度な全ゲノム解析に向けたマイクロ流体デバイスの活用
西川洋平 [Invited]
日本生物工学会東日本支部第11回学生発表討論会
Presentation date: 2016.11
マイクロドロップレットによる単一微生物からの効率的な全ゲノム増幅法の開発
西川洋平
第4回日本生物工学会東日本支部コロキウム
Presentation date: 2016
微小液滴を用いた単一微生物からの低バイアス全ゲノム増幅法の開発
西川 洋平, 細川 正人, 竹山 春子
第10回日本ゲノム微生物学会年会
Presentation date: 2016
Picoliter-sized droplets for low-bias and contamination-free reactions in whole genome amplification of single bacterial cells
Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Masato Kogawa, Haruko Takeyama
Biosensors2016
Presentation date: 2016
ピコリットル容量の微小液滴を用いた単一微生物からの網羅的な全ゲノム増幅
西川洋平, 細川正人, 小川雅人, 竹山春子
第68回日本生物工学会大会
Presentation date: 2016
DROPLET MICROFLUIDICS FOR MASSIVELY PARALLEL AND ACCURATE GENOME AMPLIFICATION OF SINGLE CELLS
Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Masato Kogawa, Haruko Takeyama
International Confrence on single cell Research 2016
Presentation date: 2016
単一細胞ゲノム解析に向けた Droplet-based multiple displacement amplification 法の開発
西川洋平, 細川正人, 竹山春子
第17回マリンバイオテクノロジー学会
Presentation date: 2015.05
マイクロ流体デバイスを用いた単一細胞解析に向けたMultiple displacement amplification (MDA) 法の開発
西川洋平
第3回日本生物工学会東日本支部コロキウム
Presentation date: 2015
Picoliter-sized droplets for low bias whole genome amplification of single cell genome
2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
Presentation date: 2015
マイクロドロップレットを用いた微生物の薬剤感受性評価
西川洋平, 細川正人, 竹山春子
第2回日本生物工学会東日本支部コロキウム
Presentation date: 2014
シングルセルゲノミクスに向けた Droplet-based Multiple Displacement Amplification 法の開発
西川洋平, 細川正人, 竹山春子
第4回CSJ化学フェスタ2014
Presentation date: 2014
単一細胞封入ドロップレットを用いた微生物の薬剤感受性評価
西川洋平, 細川正人, 竹山春子
電気化学学会第81回大会
Presentation date: 2014
Droplet-based multiple displacement amplification method for single-cell genomics using microfluidic device
10th International Symposium on Electrochemical Micro & Nanosystem Technologies (EMNT 2014)
Presentation date: 2014