論文
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Mutational destabilisation accelerates the evolution of novel sensory and network functions
Yuki Kimura, Shigeko Kawai-Noma, Daisuke Umeno
2023年11月
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A methodology for creating thermostabilized mutants of G-protein coupled receptors by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering
Kanna Sugaya, Satoshi Yasuda, Shingo Sato, Chen Sisi, Taisei Yamamoto, Daisuke Umeno, Tomoaki Matsuura, Tomohiko Hayashi, Satoshi Ogasawara, Masahiro Kinoshita, Takeshi Murata
PROTEIN SCIENCE 31 ( 9 ) 2022年09月
2被引用数(Scopus) -
Redesigning carotenoid-producing Escherichia coli to geranyl pyrophosphate accumulator
Takumi Ojima, Yusuke Otani, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Car. Sci., in press 2022年
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Oxidosqualene-based carotenoid pathway for the detection of triterpene cyclase activities
Yusuke Otani, Takumi Ojima, Miho Takemura, Norihiko Misawa, Shigeko, Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Car. Sci., in press 2022年
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Off-switching property of quorum sensor LuxR via As(III)-induced aggregation
Rina Ayuba, Daisuke Umeno, Shigeko Kawai-Noma
J. Biosci. Bioeng. 133 ( 4 ) 335 - 339 2022年
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Robust and flexible platform for directed evolution of yeast genetic switches
Masahiro Tominaga, Kenta Nozaki, Daisuke Umeno, Jun Ishii, Akihiko Kondo
Nature Communications 12 ( 1 ) 2021年12月 [査読有り]
19被引用数(Scopus) -
Improvement of the dP-nucleoside-mediated herpes simplex virus thymidine kinase negative-selection system by manipulating dP metabolism genes.
Shigeko Kawai-Noma, Kazuya Saeki, Tatsuya Yumoto, Katsuya Minakata, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Journal of bioscience and bioengineering 130 ( 2 ) 121 - 127 2020年08月 [査読有り] [国内誌]
担当区分:最終著者
2被引用数(Scopus) -
Tinglin Mu, Hajime Toyoda, Yuki Kimura, Masumi Yamada, Rie Utoh, Daisuke Umeno, Minoru Seki
Analytical Chemistry 92 ( 3 ) 2580 - 2588 2020年02月
3被引用数(Scopus) -
Molecular breeding of a biosynthetic pathway to C60 phytoene
Takahiro Seki, Tomoyuki Ichikawa, Takumi Ojima, Shigeko Kawai-Noma, Daisuke Umeno
Carotenoid science 24 18 - 23 2020年
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Pathway engineering for efficient biosynthesis of violaxanthin in Escherichia coli
Miho Takemura, Akiko Kubo, Yuki Higuchi, Takashi Maoka, Takehiko Sahara, Katsuro Yaoi, Kohji Ohdan, Daisuke Umeno, Norihiko Misawa
Applied Microbiology and Biotechnology 103 ( 23-24 ) 9393 - 9399 2019年12月
25被引用数(Scopus) -
Pathway engineering for efficient biosynthesis of violaxanthin in Escherichia coli.
Miho Takemura, Akiko Kubo, Yuki Higuchi, Takashi Maoka, Takehiko Sahara, Katsuro Yaoi, Kohji Ohdan, Daisuke Umeno, Norihiko Misawa
Applied microbiology and biotechnology 103 ( 23-24 ) 9393 - 9399 2019年12月 [査読有り] [国際誌]
25被引用数(Scopus) -
【NEDOスマートセルプロジェクト】メタボライトセンサ構築技術 スマートセル開発のためのメタボライトセンサ製作技術
関 貴洋, 小林 一幾, 梅野 太輔
バイオサイエンスとインダストリー 77 ( 6 ) 516 - 517 2019年11月
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Nonnatural biosynthetic pathway for 2-hydroxylated xanthophylls with C50-carotenoid backbone.
Ling Li, Maiko Furubayashi, Yusuke Otani, Takashi Maoka, Norihiko Misawa, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Journal of bioscience and bioengineering 128 ( 4 ) 438 - 444 2019年10月 [査読有り] [国内誌]
2被引用数(Scopus) -
Genetically engineered biosynthetic pathways for nonnatural C60 carotenoids using C5-elongases and C50-cyclases in Escherichia coli.
Ling Li, Maiko Furubayashi, Shifei Wang, Takashi Maoka, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Scientific reports 9 ( 1 ) 2982 - 2982 2019年02月 [査読有り] [国際誌]
10被引用数(Scopus) -
Construction of a pathway to C50-ε-carotene.
Yusuke Otani, Takashi Maoka, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
PloS one 14 ( 5 ) e0216729 - e0216729 2019年 [査読有り] [国際誌]
担当区分:最終著者
2被引用数(Scopus) -
細胞内のアセチル化能を感知するセンサの開発
渡邉 荘爾, 小林 一幾, 木村 友紀, 河合 繁子, 斎藤 恭一, 梅野 太輔
日本生物工学会大会講演要旨集 平成30年度 154 - 154 2018年08月
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High-resolution separation of neodymium and dysprosium ions utilizing extractant-impregnated graft-type particles.
Shoichiro Uchiyama, Takaaki Sasaki, Ryo Ishihara, Kunio Fujiwara, Takanobu Sugo, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito
Journal of chromatography. A 1533 10 - 16 2018年01月 [査読有り] [国際誌]
4被引用数(Scopus) -
Reduction of Supercooling of Heavy Water with Silver Iodide
日本海水学会誌 72 ( 1 ) 41 - 42 2018年
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N-ビニルピロリドン(NVP)グラフト重合繊維を用いた緑茶抽出液中のカテキンの吸着および水酸化ナトリウム水溶液を用いたカテキンの溶出
川村 竜之介, 木下 亜希子, 工藤 あずさ, 日置 淳平, 若林 英行, 後藤 聖太, 松浦 佑樹, 河合(野間) 繁子, 梅野 太輔, 斎藤 恭一, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 矢島 由莉佳
化学工学論文集 44 ( 2 ) 99 - 102 2018年
1被引用数(Scopus) -
Directed evolution and expression tuning of geraniol synthase for efficient geraniol production in Escherichia coli.
Miki Tashiro, Akira Fujii, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
The Journal of general and applied microbiology 63 ( 5 ) 287 - 295 2017年11月 [査読有り] [国内誌]
10被引用数(Scopus) -
早川 里奈, 成毛 翔子, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 小島 隆, 河合(野間) 繁子, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
分析化学 66 ( 11 ) 853 - 856 2017年
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放射線前照射乳化グラフト重合法を適用したタンパク質を高容量に吸着するためのカチオン交換繊維の作製
松﨑 優香, 工藤 大樹, 小島 隆, 河合(野間) 繁子, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
化学工学論文集 43 ( 2 ) 88 - 94 2017年
2被引用数(Scopus) -
Directed evolution of the autoinducer selectivity of Vibrio fischeri LuxR.
Yohei Tashiro, Yuki Kimura, Maiko Furubayashi, Akira Tanaka, Kei Terakubo, Kyoichi Saito, Shigeko Kawai-Noma, Daisuke Umeno
The Journal of general and applied microbiology 62 ( 5 ) 240 - 247 2016年11月 [査読有り] [国内誌]
16被引用数(Scopus) -
Rapid Diversification of BetI-Based Transcriptional Switches for the Control of Biosynthetic Pathways and Genetic Circuits.
Kazuya Saeki, Masahiro Tominaga, Shigeko Kawai-Noma, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
ACS synthetic biology 5 ( 11 ) 1201 - 1210 2016年11月 [査読有り] [国際誌]
22被引用数(Scopus) -
Impregnation structure of cobalt ferrocyanide microparticles by the polymer chain grafted onto nylon fiber
Shota Goto, Satoshi Umino, Wataru Amakai, Kunio Fujiwara, Takanobu Sugo, Takashi Kojima, Shigeko Kawai-Noma, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito
JOURNAL OF NUCLEAR SCIENCE AND TECHNOLOGY 53 ( 9 ) 1251 - 1255 2016年 [査読有り]
13被引用数(Scopus) -
中村 祐樹, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 河合(野間) 繁子, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
化学工学論文集 42 ( 3 ) 113 - 118 2016年
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A highly selective biosynthetic pathway to non-natural C50 carotenoids assembled from moderately selective enzymes.
Maiko Furubayashi, Mayu Ikezumi, Shinichi Takaichi, Takashi Maoka, Hisashi Hemmi, Takuya Ogawa, Kyoichi Saito, Alexander V Tobias, Daisuke Umeno
Nature communications 6 7534 - 7534 2015年07月 [査読有り] [国際誌]
58被引用数(Scopus) -
リン酸ビス(2-エチルヘキシル)(HDEHP)担持繊維充填カラムを用いた固相抽出法に基づく溶出クロマトグラフィーによるNdとDyの分離
佐々木 貴明, 内山 翔一朗, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
化学工学論文集 41 ( 4 ) 220 - 227 2015年
2被引用数(Scopus) -
ドデシルアミノ基を有するグラフト鎖上に担持した酸性抽出試薬リン酸ビス(2-エチルヘキシル)(HDEHP)とドデカンに溶解したHDEHPのレアアース抽出での類似性
佐々木 貴明, 内山 翔一朗, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
化学工学論文集 40 ( 5 ) 404 - 409 2014年
3被引用数(Scopus) -
Simple Method for High-Density Impregnation of Aliquat 336 onto Porous Sheet and Binding Performance of Resulting Sheet for Palladium Ions
Ryota Tanaka, Ryo Ishihara, Kazuyoshi Miyoshi, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Shiho Asai, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota
SEPARATION SCIENCE AND TECHNOLOGY 49 ( 1 ) 154 - 159 2014年01月 [査読有り]
4被引用数(Scopus) -
Effect of Dose on Mole Percentages of Polymer Brush and Root Grafted onto Porous Polyethylene Sheet by Radiation-Induced Graft Polymerization
Ryo Ishihara, Shoichiro Uchiyama, Hidekazu Ikezawa, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito
INDUSTRIAL & ENGINEERING CHEMISTRY RESEARCH 52 ( 35 ) 12582 - 12586 2013年09月 [査読有り]
9被引用数(Scopus) -
Dependence of protein binding capacity of dimethylamino-gamma-butyric-acid (DMGABA)-immobilized porous membrane on composition of solvent used for DMGABA immobilization
Akio Iwanade, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Takanobu Sugo
RADIATION PHYSICS AND CHEMISTRY 87 53 - 58 2013年06月 [査読有り]
4被引用数(Scopus) -
不溶性フェロシアン化物担持繊維のセシウム吸着容量に及ぼすセシウム水溶液の塩濃度の効果
平山 雄祥, 岡村 雄介, 藤原 邦夫, 須郷 高信, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
化学工学論文集 = Kagaku kogaku ronbunshu 39 ( 1 ) 28 - 32 2013年03月
7被引用数(Scopus) -
Crosslinked-Chelating Porous Sheet with High Dynamic Binding Capacity of Metal Ions
Go Wada, Ryo Ishihara, Kazuyoshi Miyoshi, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Shiho Asai, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota
Solvent Extraction and Ion Exchange 31 ( 2 ) 210 - 220 2013年03月 [査読有り]
3被引用数(Scopus) -
岡村 雄介, 藤原 邦夫, 飯島 直樹, 正田 哲也, 鈴木 晃一, 須郷 高信, 清水 威, 板垣 龍人, 高橋 淳, 小野 孝之, 菊池 隆, 染谷 孝明, 石原 量, 小島 隆, 梅野 太輔, 斎藤 恭一
日本イオン交換学会誌 24 ( 1 ) 8 - 13 2013年 [査読有り]
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Immobilization of an esterase inhibitor on a porous hollow-fiber membrane by radiation-induced graft polymerization for developing a diagnostic tool for feline kidney diseases.
Shinya Matsuno, Daisuke Umeno, Masao Miyazaki, Yasuyuki Suzuta, Kyoichi Saito, Tetsuro Yamashita
Bioscience, biotechnology, and biochemistry 77 ( 10 ) 2061 - 4 2013年 [査読有り] [国際誌]
2被引用数(Scopus) -
Protein-Binding Characteristics of Anion-Exchange Particles Prepared by Radiation-Induced Graft Polymerization at Low Temperatures
Yuichi Shimoda, Yuta Sekiya, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Goro Furumoto, Hironobu Shirataki, Naohiro Shinohara, Noboru Kubota
JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING OF JAPAN 46 ( 9 ) 588 - 592 2013年 [査読有り]
4被引用数(Scopus) -
Determination of Mole Percentages of Brush and Root of Polymer Chain Grafted onto Porous Sheet
Shoichiro Uchiyama, Ryo Ishihara, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota, Shiho Asai
JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING OF JAPAN 46 ( 6 ) 414 - 419 2013年 [査読有り]
8被引用数(Scopus) -
Protein Resolution in Elution Chromatography Using Novel Cation-Exchange Polymer-Brush-Immobilized Particles
Takato Harayama, Yusuke Okamura, Yuichi Shimoda, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Naoyuki Shinohara, Noboru Kubota
JOURNAL OF CHEMICAL ENGINEERING OF JAPAN 45 ( 11 ) 896 - 902 2012年 [査読有り]
3被引用数(Scopus) -
DEPENDENCE OF LANTHANIDE-ION BINDING PERFORMANCE ON HDEHP CONCENTRATION IN HDEHP IMPREGNATION TO POROUS SHEET
Ryo Ishihara, Shiho Asai, Shigeyoshi Otosaka, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota, Kazuyoshi Miyoshi, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito
SOLVENT EXTRACTION AND ION EXCHANGE 30 ( 2 ) 171 - 180 2012年 [査読有り]
9被引用数(Scopus) -
A system for the rapid determination of the mutation spectrum in Escherichia coli.
Yohei Tashiro, Akinori Katabami, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry 28 ( 2 ) 95 - 101 2012年 [査読有り] [国内誌]
1被引用数(Scopus) -
Removal of Cesium Using Cobalt-Ferrocyanide-Impregnated Polymer-Chain-Grafted Fibers
Ryo Ishihara, Kunio Fujiwara, Takato Harayama, Yusuke Okamura, Shoichiro Uchiyama, Mai Sugiyama, Taka-aki Someya, Wataru Amakai, Satoshi Umino, Tsubasa Ono, Aguru Nide, Yuya Hirayama, Tsukasa Baba, Takashi Kojima, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Shiho Asai, Takanobu Sugo
JOURNAL OF NUCLEAR SCIENCE AND TECHNOLOGY 48 ( 10 ) 1281 - 1284 2011年10月 [査読有り]
52被引用数(Scopus) -
ASARI Yuki, SHOJI Nobuyoshi, MIYOSHI Kazuyoshi, UMENO Daisuke, SAITO Kyoichi
日本イオン交換学会誌 22 ( 2 ) 53 - 57 2011年 [査読有り]
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Modification of a hydrophobic-ligand-containing porous sheet using tri-n-octylphosphine oxide, and its adsorption/elution of bismuth ions
Ryota Tanaka, Ryo Ishihara, Kazuyoshi Miyoshi, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Shiho Asai, Shinsuke Yamada, Hideyuki Hirota
REACTIVE & FUNCTIONAL POLYMERS 70 ( 12 ) 986 - 990 2010年12月 [査読有り]
8被引用数(Scopus) -
High-throughput solid-phase extraction of metal ions using an iminodiacetate chelating porous disk prepared by graft polymerization.
Kohei Yamashiro, Kazuyoshi Miyoshi, Ryo Ishihara, Daisuke Umeno, Kyoichi Saito, Takanobu Sugo, Shinsuke Yamada, Hiroyuki Fukunaga, Masanori Nagai
Journal of chromatography. A 1176 ( 1-2 ) 37 - 42 2007年12月 [査読有り] [国際誌]
22被引用数(Scopus) -
Probing the mutation spectrum in E. coli.
Tsuyoshi Suzuki, Keiichi Suzuki, Yohei Tashiro, Kyoichi Saito, Daisuke Umeno
Nucleic acids symposium series (2004) ( 51 ) 289 - 90 2007年 [査読有り] [国際誌]
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Diversifying carotenoid biosynthetic pathways by directed evolution.
Daisuke Umeno, Alexander V Tobias, Frances H Arnold
Microbiology and molecular biology reviews : MMBR 69 ( 1 ) 51 - 78 2005年03月 [査読有り] [国際誌]
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Evolution of a pathway to novel long-chain carotenoids.
Daisuke Umeno, Frances H Arnold
Journal of bacteriology 186 ( 5 ) 1531 - 6 2004年03月 [査読有り] [国際誌]
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Engineering proteins that bind, move, make and break DNA.
Cynthia H Collins, Yohei Yokobayashi, Daisuke Umeno, Frances H Arnold
Current opinion in biotechnology 14 ( 6 ) 665 - 665 2003年12月 [査読有り] [国際誌]
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Method to protect a targeted amino acid residue during random mutagenesis.
Daisuke Umeno, Kaori Hiraga, Frances H Arnold
Nucleic acids research 31 ( 16 ) e91 2003年08月 [査読有り] [国際誌]
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A C35 carotenoid biosynthetic pathway.
Daisuke Umeno, Frances H Arnold
Applied and environmental microbiology 69 ( 6 ) 3573 - 9 2003年06月 [査読有り] [国際誌]
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Generating mutant libraries using error-prone PCR.
Patrick C Cirino, Kimberly M Mayer, Daisuke Umeno
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 231 3 - 9 2003年 [査読有り] [国際誌]
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Evolution of the C30 carotenoid synthase CrtM for function in a C40 pathway.
Daisuke Umeno, Alexander V Tobias, Frances H Arnold
Journal of bacteriology 184 ( 23 ) 6690 - 9 2002年12月 [査読有り] [国際誌]
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Affinity precipitation separation of DNA binding protein using block conjugate composed of poly(N-isopropylacrylamide) grafted double-stranded DNA and double-stranded DNA containing a target sequence.
Nobuaki Soh, Daisuke Umeno, Zhonglan Tang, Masaharu Murata, Mizuo Maeda
Analytical sciences : the international journal of the Japan Society for Analytical Chemistry 18 ( 12 ) 1295 - 9 2002年12月 [査読有り] [国内誌]
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Cooperativity vs. Phase transition in a giant single DNA molecule
T. Iwataki, K. Yoshikawa, S. Kidoaki, D. Umeno, M. Kiji, M. Maeda
Journal of the American Chemical Society 122 ( 41 ) 9891 - 9896 2000年10月 [査読有り]
23被引用数(Scopus) -
Molecular breeding of carotenoid biosynthetic pathways
Claudia Schmidt-Dannert, Daisuke Umeno, Frances H. Arnold
Nature Biotechnology 18 ( 7 ) 750 - 753 2000年07月 [査読有り]
303被引用数(Scopus) -
Umeno Daisuke, Kiji Masami, Murata Masaharu, MAEDA Mizuo
Polymer journal 31 ( 11_2 ) 1109 - 1114 1999年11月 [査読有り]
8被引用数(Scopus) -
Daisuke Umeno, Mizuo Maeda
Chemistry Letters 28 ( 5 ) 381 - 382 1999年 [査読有り]
7被引用数(Scopus) -
Daisuke Umeno, Masafumi Kawasaki, Mizuo Maeda
Bioconjugate Chemistry 9 ( 6 ) 719 - 724 1998年11月 [査読有り]
担当区分:筆頭著者
50被引用数(Scopus) -
Daisuke Umeno, Mizuo Maeda
Chemical Communications ( 14 ) 1433 - 1434 1998年 [査読有り]
担当区分:筆頭著者
40被引用数(Scopus)
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