山本 裕 (ヤマモト ユウ)

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所属

教育・総合科学学術院 教育学部

職名

助手

学歴 【 表示 / 非表示

  • 2017年04月
    -
    継続中

    早稲田大学   大学院先進理工学研究科   生命理工学専攻 博士課程  

  • 2015年04月
    -
    2017年03月

    早稲田大学   大学院先進理工学研究科   生命理工学専攻 修士課程  

  • 2011年04月
    -
    2015年03月

    早稲田大学   教育学部   理学科 生物学専修  

経歴 【 表示 / 非表示

  • 2019年04月
    -
    継続中

    早稲田大学   教育・総合科学学術院   助手

所属学協会 【 表示 / 非表示

  •  
     
     

    米国細胞生物学会

  •  
     
     

    日本分子生物学会

  •  
     
     

    日本生化学会

 

研究分野 【 表示 / 非表示

  • 細胞生物学

  • 分子生物学

  • ゲノム生物学

論文 【 表示 / 非表示

  • Cruciform Formable Sequences within Pou5f1 Enhancer Are Indispensable for Mouse ES Cell Integrity.

    Yu Yamamoto, Osamu Miura, Takashi Ohyama

    International journal of molecular sciences   22 ( 7 )  2021年03月  [国際誌]

     概要を見る

    DNA can adopt various structures besides the B-form. Among them, cruciform structures are formed on inverted repeat (IR) sequences. While cruciform formable IRs (CFIRs) are sometimes found in regulatory regions of transcription, their function in transcription remains elusive, especially in eukaryotes. We found a cluster of CFIRs within the mouse Pou5f1 enhancer. Here, we demonstrate that this cluster or some member(s) plays an active role in the transcriptional regulation of not only Pou5f1, but also Sox2, Nanog, Klf4 and Esrrb. To clarify in vivo function of the cluster, we performed genome editing using mouse ES cells, in which each of the CFIRs was altered to the corresponding mirror repeat sequence. The alterations reduced the level of the Pou5f1 transcript in the genome-edited cell lines, and elevated those of Sox2, Nanog, Klf4 and Esrrb. Furthermore, transcription of non-coding RNAs (ncRNAs) within the enhancer was also upregulated in the genome-edited cell lines, in a similar manner to Sox2, Nanog, Klf4 and Esrrb. These ncRNAs are hypothesized to control the expression of these four pluripotency genes. The CFIRs present in the Pou5f1 enhancer seem to be important to maintain the integrity of ES cells.

    DOI PubMed